2020 yılında tüm dünyayı etkisi altına alan COVID-19 Pandemisi bilindiği üzere havacılık sektörünü son derece olumsuz bir şekilde etkilemiştir. ICAO (International Civil Aviation Organization) verilerine göre 2020 yılındaki tüm dünyadaki ticari yolcu trafiği 2019'a göre ortalama %60 oranında düşmüş; bu düşüş 2021 ile 2019 arasında ancak %49'a gerileyebilmiştir. Bu tablo içerisinde Eskişehir Hasan Polatkan Havalimanı'nda gerçekleşen yolcu trafiğine COVID-19 etkisi dünya ortalamalarının altında kalmış olup 2020-2019 düşüş yüzdesi %40'lar seviyesinde sonuçlanmıştır. Bununla birlikte özellikle 2021 yılı yaz sezonu uçuşları ile birlikte havalimanımızın 2021 yılı içerisinde pandemi etkilerinden tamamen iyileştiği ifade edilebilir.
Havalimanımız özellikle 2018 ve 2021 yıllarında iç hat ve dış hat toplam hizmet verdiği yolcu sayısı olarak 99,000 rakamını aşmış, ancak kritik 100,000 yolcu sayısına ulaşmak mümkün olmamıştı. Özellikle 2021 yılında havacılık sektöründe oluşan momentum, aynı yıl Umre ve Haç uçuşlarına henüz izin verilmediği için kritik sınırın aşılması için yeterli olmamıştı. Ancak 2022 yılı içerisinde Temmuz ayı ile başlayan Haç uçuşları ve Aralık ayında hız kazanan Umre uçuşları ile 2022 yılı itibarıyla kritik 100,000 yolcu sınırının ciddi bir oranda aşılmasını sağlamış ve yıllık toplam 117,598 yolcu sayısına ulaşılmıştır.
Yolcu Sayıları
| Yıl | İç Hat Yolcu Sayısı | Dış Hat Yolcu Sayısı | Toplam |
| 2015 | 2702 | 49,762 | 52,464 |
| 2016 | 1424 | 55,536 | 56,960 |
| 2017 | 2794 | 78,122 | 80,916 |
| 2018 | 1592 | 98,230 | 99,822 |
| 2019 | 1175 | 86,613 | 87,788 |
| 2020 | 165 | 54,912 | 55,077 |
| 2021 | 1498 | 97,674 | 99,172 |
| 2022 | 666 | 116,932 | 117,598 |
Uçuş Sayıları
| Yıl | İç Hat Uçuş Sayısı | Dış Hat Uçuş Sayısı | Toplam |
| 2015 | 320 | 509 | 829 |
| 2016 | 335 | 473 | 808 |
| 2017 | 395 | 671 | 1066 |
| 2018 | 334 | 744 | 1078 |
| 2019 | 289 | 663 | 952 |
| 2020 | 290 | 456 | 746 |
| 2021 | 227 | 837 | 1064 |
| 2022 | 209 | 901 | 1110 |